218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1100 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
924 aa  1821    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
1301 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  34.14 
 
 
1303 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
1239 aa  328  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
1292 aa  312  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
1265 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  34.79 
 
 
1271 aa  307  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
1220 aa  295  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  29.92 
 
 
1147 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  25.19 
 
 
1608 aa  212  3e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.02 
 
 
1867 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
740 aa  163  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
740 aa  163  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 
828 aa  144  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
404 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
404 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 
953 aa  108  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
539 aa  106  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
384 aa  104  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
386 aa  104  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
414 aa  101  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
452 aa  99.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
445 aa  98.6  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
1476 aa  97.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
441 aa  97.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
447 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
414 aa  89.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
440 aa  84  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
673 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
466 aa  80.9  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
403 aa  79  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  26.85 
 
 
403 aa  79  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  32.21 
 
 
1444 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
782 aa  75.5  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  20.9 
 
 
778 aa  72  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1400  hypothetical protein  27.81 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.19 
 
 
412 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
1317 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
425 aa  70.1  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  25.23 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  22.61 
 
 
452 aa  65.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
418 aa  65.1  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
1400 aa  65.1  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
397 aa  64.7  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.77 
 
 
397 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
410 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
419 aa  63.9  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
392 aa  62.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.52 
 
 
366 aa  62.4  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
417 aa  62  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  31.1 
 
 
398 aa  62  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  29.41 
 
 
331 aa  61.2  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  35.64 
 
 
339 aa  61.2  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
361 aa  60.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
404 aa  60.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
1193 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
733 aa  60.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
1035 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
379 aa  59.3  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2598  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 
418 aa  58.9  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.8 
 
 
2401 aa  58.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3298  hypothetical protein  39.18 
 
 
333 aa  58.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0661206  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2765  hypothetical protein  25.51 
 
 
414 aa  58.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
1059 aa  58.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
354 aa  58.2  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5020  hypothetical protein  33.93 
 
 
348 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 
1313 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  23.67 
 
 
396 aa  57  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  25.07 
 
 
814 aa  57  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
403 aa  55.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  33.08 
 
 
371 aa  55.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  30.89 
 
 
361 aa  55.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
420 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
995 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
367 aa  55.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  25.77 
 
 
401 aa  54.7  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  22.25 
 
 
415 aa  54.7  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  27.8 
 
 
341 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4205  Glycosyltransferase-like protein  22.79 
 
 
372 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 
772 aa  53.9  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
359 aa  53.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 
1322 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  32.31 
 
 
361 aa  52.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5347  hypothetical protein  29.85 
 
 
337 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
369 aa  52.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
371 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
394 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
413 aa  52.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
1187 aa  52  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  24.24 
 
 
384 aa  52  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  38.27 
 
 
1192 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
414 aa  52  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
403 aa  52  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
352 aa  51.6  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
445 aa  51.6  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>