80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0686 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  758    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.13 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 		 828 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  38.39 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  31.03 
 
 		 1147 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  34.19 
 
 		 361 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  27.61 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 1303 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 		 924 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  30.89 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  29.17 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.09 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  27.87 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 394 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 1301 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 		 1476 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 		 953 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 343 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 368 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 		 1177 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.28 
 
 		 2401 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 		 1177 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 		 348 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2810  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.2 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5020  hypothetical protein  37.84 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0741  glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 426 aa  46.2  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.45783 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0542  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 406 aa  46.2  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000128948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  30.53 
 
 		 1608 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2076  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249499  normal  0.0477078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  42.03 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  26.5 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 740 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 740 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  37.21 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 519 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  29.13 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.19 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.53 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 427 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  36.05 
 
 		 417 aa  43.1  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  25.63 
 
 		 385 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3347  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 400 aa  43.1  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 		 390 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 377 aa  42.7  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 		 402 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  40.91 
 
 		 380 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>