176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4264 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 364 aa  746    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  83.15 
 
 		 367 aa  615  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  37.67 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.78 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  36.77 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  37.6 
 
 		 359 aa  202  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 368 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  37.84 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  35.89 
 
 		 361 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  30.05 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 357 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  29.7 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  26.92 
 
 		 384 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  27.64 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  26.43 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  40.71 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  25.19 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 828 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  37.89 
 
 		 1444 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  22.49 
 
 		 2401 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  25.18 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  25.31 
 
 		 1121 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 953 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  19.7 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 		 414 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  28.68 
 
 		 1608 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  24.12 
 
 		 1476 aa  56.2  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 1265 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  18.58 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 1292 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 1271 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  21.84 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  29.73 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 740 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 740 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 417 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 417 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 		 371 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 408 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  27.63 
 
 		 1147 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 361 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  30.84 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 550 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 1220 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 1239 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 1303 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 399 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  31.03 
 
 		 404 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  28.42 
 
 		 389 aa  50.1  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 		 397 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 		 389 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  30.32 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 		 744 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 924 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  28.16 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  38 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 3172 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 1340 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  26.7 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  22.38 
 
 		 365 aa  47.4  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  22.62 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>