210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2590 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  100 
 
 
331 aa  683    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  38.44 
 
 
368 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  37.5 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  37.2 
 
 
359 aa  218  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
360 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.24 
 
 
366 aa  190  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  32.77 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  33.43 
 
 
361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  35.59 
 
 
361 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
371 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 
354 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  33.72 
 
 
384 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
359 aa  169  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
367 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 
356 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
364 aa  165  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
354 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  32.89 
 
 
333 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
357 aa  153  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  28.92 
 
 
361 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
828 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  24.48 
 
 
1444 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  25.81 
 
 
1147 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  22.66 
 
 
1608 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
360 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
1301 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
924 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
403 aa  60.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
393 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  23.25 
 
 
373 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 
397 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
1303 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
1192 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.29 
 
 
2401 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  27.61 
 
 
371 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5347  hypothetical protein  24.47 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
1271 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  22.81 
 
 
398 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
1265 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
740 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
740 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25.81 
 
 
411 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  21.93 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
414 aa  54.3  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  25.99 
 
 
414 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  23.64 
 
 
402 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
403 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
1292 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  25.26 
 
 
935 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5020  hypothetical protein  21.17 
 
 
348 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
414 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
507 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
372 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 
404 aa  52.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  22.79 
 
 
360 aa  52.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  24.38 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  20.87 
 
 
1121 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  21.4 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.48 
 
 
371 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 
413 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.33 
 
 
396 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  21.16 
 
 
1476 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3298  hypothetical protein  24.12 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0661206  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
409 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
409 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  18.84 
 
 
390 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 
405 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
463 aa  50.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 
1190 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 
409 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  36.14 
 
 
375 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  28.57 
 
 
404 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  18.48 
 
 
390 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.85 
 
 
398 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 
365 aa  49.7  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 
3172 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  22.5 
 
 
402 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
378 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  24.64 
 
 
535 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.13 
 
 
1191 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  26.58 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3909  hypothetical protein  27.04 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
399 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
743 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
953 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  25 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
375 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
399 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>