55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1515 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1094    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  31.76 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1396  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.34 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40 
 
 		 764 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  33.49 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0970  hypothetical protein  26.57 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5334  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 178 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  29.22 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  28.86 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  40.45 
 
 		 643 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 596 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4208  hypothetical protein  27.59 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3961  methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0335646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  31.25 
 
 		 197 aa  57  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 197 aa  57  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  36.26 
 
 		 196 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 197 aa  55.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 442 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 201 aa  54.7  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 278 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 442 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2813  hypothetical protein  27.33 
 
 		 240 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00156648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  33.03 
 
 		 172 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  35.96 
 
 		 192 aa  51.2  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 241 aa  50.8  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0534  hypothetical protein  30.77 
 
 		 208 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3799  hypothetical protein  27.98 
 
 		 220 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  24.64 
 
 		 331 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1050  hypothetical protein  28.06 
 
 		 208 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 339 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  42.31 
 
 		 1476 aa  48.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  40.23 
 
 		 194 aa  47.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 254 aa  47.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 248 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 248 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 197 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.23 
 
 		 236 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 711 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 		 974 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1031  methyltransferase type 11  40 
 
 		 224 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 267 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  31.82 
 
 		 299 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 254 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 710 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1151  hypothetical protein  24.86 
 
 		 219 aa  44.3  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 354 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  30.68 
 
 		 299 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  28.83 
 
 		 172 aa  43.5  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2737  hypothetical protein  40.35 
 
 		 305 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.447788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 242 aa  43.5  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 239 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 885 aa  43.5  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  29.09 
 
 		 298 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>