More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1373 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  80.69 
 
 		 1301 aa  2048    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  49.64 
 
 		 1271 aa  1053    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  49.08 
 
 		 1265 aa  1067    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  44.21 
 
 		 1220 aa  962    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  51.71 
 
 		 1239 aa  1107    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  50.39 
 
 		 1292 aa  1097    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 1303 aa  2608    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.91 
 
 		 1867 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  35.58 
 
 		 1147 aa  532  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  30.02 
 
 		 1608 aa  338  5e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  33.84 
 
 		 924 aa  323  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  40.25 
 
 		 404 aa  302  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  40.25 
 
 		 404 aa  302  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 740 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 740 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7833  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 732 aa  192  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 828 aa  120  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 953 aa  119  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 1476 aa  116  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 1067 aa  102  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 539 aa  102  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 447 aa  98.6  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 673 aa  98.2  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 441 aa  94.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  25.32 
 
 		 403 aa  92.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 403 aa  92.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.47 
 
 		 2401 aa  90.1  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 384 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 418 aa  84  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 1400 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 733 aa  80.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 		 436 aa  73.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 393 aa  72  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.7 
 
 		 412 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  21.68 
 
 		 778 aa  70.9  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 782 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 452 aa  70.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  24.85 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 391 aa  68.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 425 aa  67  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 397 aa  67  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 414 aa  67.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 466 aa  67.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  40.59 
 
 		 370 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 1193 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4205  Glycosyltransferase-like protein  27.1 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 369 aa  64.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 		 1035 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  24 
 
 		 377 aa  64.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 		 406 aa  64.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  26.71 
 
 		 384 aa  64.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 440 aa  64.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  26.03 
 
 		 413 aa  64.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 		 413 aa  63.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  26.35 
 
 		 1059 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 		 390 aa  63.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 		 445 aa  63.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 462 aa  63.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0478  glycosyl transferase, group 1  18.75 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.038549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  30.13 
 
 		 1121 aa  62  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 360 aa  61.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  39.77 
 
 		 376 aa  61.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1499  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 371 aa  60.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.415023  normal  0.860019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1780  glycosyl transferase group 1  44.78 
 
 		 354 aa  60.1  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  28.57 
 
 		 378 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  37.86 
 
 		 372 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 360 aa  60.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 375 aa  60.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 		 354 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4020  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  39.36 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3945  hypothetical protein  41.94 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  39.36 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  39.36 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  39.36 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  28.67 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.03 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 403 aa  58.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 		 814 aa  58.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1421  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 399 aa  58.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 		 354 aa  57.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>