107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0384 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  100 
 
 		 384 aa  799    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  63.66 
 
 		 333 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  53.27 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  33.72 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 		 359 aa  143  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  29.45 
 
 		 339 aa  132  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 		 367 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 371 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  26.8 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 352 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  28.98 
 
 		 361 aa  107  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  28.69 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.63 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 		 828 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 		 1292 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  24.57 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  36.67 
 
 		 2401 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  26.74 
 
 		 1121 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 953 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  27.87 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.89 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.89 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  22.45 
 
 		 740 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  22.45 
 
 		 740 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.54 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.54 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.54 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.54 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.54 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1444 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0054  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510495  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.05 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  26.51 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  22 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  29.81 
 
 		 1147 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1658  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00025615  hitchhiker  0.00378247 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  22.37 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  27.44 
 
 		 443 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 924 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 360 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  24.83 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  19.86 
 
 		 456 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  22.7 
 
 		 374 aa  47  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0801  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  36.36 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 517 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  34.12 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1661  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000116715  hitchhiker  0.00132012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  33.87 
 
 		 741 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0147  helix-turn-helix, AraC type  32.93 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.586642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 753 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  23.13 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.14 
 
 		 249 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  26.74 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  24.32 
 
 		 148 aa  44.3  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  22.71 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1957  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.29 
 
 		 366 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 550 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  29.63 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 382 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  30 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 384 aa  43.1  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 		 382 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>