More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0147 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0147  helix-turn-helix, AraC type  100 
 
 		 395 aa  815    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.586642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 748 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  45.45 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  32.24 
 
 		 638 aa  69.7  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 		 388 aa  67  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  27.33 
 
 		 364 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 377 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2957  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  33.64 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 		 689 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  32.58 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  39.29 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  29.56 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3362  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.2 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.71 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.73 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.73 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.5 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 		 507 aa  63.2  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0567  glycosyl transferase group 1  40.24 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.923327  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.16 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.57 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2329  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0153585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  24.18 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  24.42 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2749  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1658  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00025615  hitchhiker  0.00378247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 		 828 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>