More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1957 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1957  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
366 aa  758    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
390 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  27.59 
 
 
822 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
403 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
396 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
375 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
393 aa  96.3  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
468 aa  93.6  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
377 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
399 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
372 aa  91.3  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
384 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  28.51 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
378 aa  89.7  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.09 
 
 
381 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  25.09 
 
 
381 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  25.09 
 
 
381 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.09 
 
 
381 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  25.09 
 
 
381 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.09 
 
 
381 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 
412 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 
412 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  26.8 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.68 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
385 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.4 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
389 aa  86.3  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.68 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.55 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0588  glycosyl transferase, group 1  22.45 
 
 
367 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.147569  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  34.67 
 
 
745 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.22 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  27.74 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  30.49 
 
 
745 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  23.12 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2598  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.52 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
819 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
456 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.93 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
505 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12403  Glycosyl transferase, group 1  34.67 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0809877  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  38.78 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  26.67 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.46 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  38.54 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.48 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  25.14 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  38.39 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2745  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
379 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.88 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  36.61 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
822 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0553  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>