More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5592 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 333 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  58.28 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  51.43 
 
 		 329 aa  355  5e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  54.87 
 
 		 330 aa  352  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  53.82 
 
 		 316 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  54.14 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  53.18 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  53.18 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.92 
 
 		 316 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  52.92 
 
 		 316 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.92 
 
 		 316 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  52.24 
 
 		 316 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  52.41 
 
 		 316 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  50.97 
 
 		 465 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  50.97 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  52.08 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  52.08 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  50.65 
 
 		 318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  47.28 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  47.73 
 
 		 314 aa  297  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  52.63 
 
 		 233 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  52.63 
 
 		 233 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 		 315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 		 319 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  36.96 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  35.96 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  33.33 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 		 350 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  34.98 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  33.64 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  34.66 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  33.54 
 
 		 326 aa  169  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  47.95 
 
 		 81 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  47.95 
 
 		 81 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2850  hypothetical protein  27.57 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3461  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2417  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  27.36 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 372 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 384 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0691  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124167  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 386 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  29.23 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 407 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  28.16 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 414 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 388 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 387 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2121  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 372 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.430294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 424 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1908  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 377 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.446815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1626  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 377 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.726366  decreased coverage  0.00120235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  26.32 
 
 		 458 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0741  glycosyltransferase-like protein  39.53 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.45783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4585  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  26.36 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 		 420 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 378 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1610  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.0108296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 424 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0044  glycosyltransferase  32.08 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 421 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4095  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 414 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166575  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  27.91 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8126  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 368 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 439 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 392 aa  49.7  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 411 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 		 359 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 398 aa  49.7  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 394 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.43 
 
 		 381 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 		 457 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24.81 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3765  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.43 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1900  hypothetical protein  27.35 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744765  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  21.02 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0844  putative glycosyltransferase  29.91 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0684167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>