45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1761 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  93.85 
 
 		 325 aa  586  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  62.11 
 
 		 315 aa  381  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  60.68 
 
 		 319 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  60.68 
 
 		 326 aa  360  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  60.19 
 
 		 350 aa  355  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  62.46 
 
 		 319 aa  344  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  55.17 
 
 		 342 aa  334  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  55.52 
 
 		 314 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  53.11 
 
 		 338 aa  308  9e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  38.29 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  38.96 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 		 318 aa  188  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  34.86 
 
 		 347 aa  185  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 		 465 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  36.99 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.99 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.99 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  40.62 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  40.62 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  35.29 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  36.14 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  36.14 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  31.78 
 
 		 233 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  31.78 
 
 		 233 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  49.32 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  49.32 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4369  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00420943  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 392 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 387 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 401 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  22.88 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2850  hypothetical protein  29.27 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1428  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.17 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 		 458 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  30.36 
 
 		 382 aa  42.4  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>