233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4887 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 330 aa  676    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 330 aa  676    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  69.3 
 
 		 315 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  65.94 
 
 		 318 aa  427  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  64.2 
 
 		 316 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  64.2 
 
 		 316 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  63.27 
 
 		 316 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  64.06 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  62.96 
 
 		 316 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  62.96 
 
 		 316 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.38 
 
 		 316 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.38 
 
 		 316 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  63.27 
 
 		 316 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  61.3 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  60.13 
 
 		 329 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  58.36 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  52.08 
 
 		 333 aa  323  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  51.58 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  65.52 
 
 		 233 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  65.52 
 
 		 233 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  47.17 
 
 		 314 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  47.65 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  42.44 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  37.34 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  38.29 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  38.05 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  41.19 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  36.12 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  40.62 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  35.62 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  34.69 
 
 		 338 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  40.31 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  55.56 
 
 		 81 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  55.56 
 
 		 81 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 748 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2850  hypothetical protein  24.58 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 387 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 371 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  36.78 
 
 		 370 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  36.67 
 
 		 391 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3461  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 353 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  27.12 
 
 		 416 aa  52.8  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.89 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.22 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5908  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  34.78 
 
 		 392 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  30.25 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 366 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.22 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 		 364 aa  50.8  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 422 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 402 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  27.45 
 
 		 384 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 		 398 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  34 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 		 411 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.22 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  32.22 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  32.22 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.22 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  32.22 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 420 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.22 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1718  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 433 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  27.96 
 
 		 458 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 		 381 aa  50.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0054  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510495  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  29.2 
 
 		 385 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2910  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.168216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 370 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0507  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 424 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1760  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 		 428 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 414 aa  49.7  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.03 
 
 		 249 aa  49.3  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  33.33 
 
 		 366 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 366 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 		 360 aa  49.3  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2121  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.430294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 375 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  31.78 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  30.69 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  31.78 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>