53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0458 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0458  transferase  100 
 
 
326 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  65.33 
 
 
319 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  65.54 
 
 
350 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  61.92 
 
 
325 aa  364  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  59.63 
 
 
315 aa  361  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  60.68 
 
 
325 aa  359  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  65.34 
 
 
319 aa  359  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  60.44 
 
 
314 aa  345  5e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  57.36 
 
 
342 aa  338  7e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  58.77 
 
 
338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  40.67 
 
 
316 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  40.67 
 
 
316 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  40.37 
 
 
316 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  40.18 
 
 
316 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  40.18 
 
 
316 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  37.8 
 
 
347 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  39.26 
 
 
316 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  36.28 
 
 
465 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  38.84 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  39.57 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.26 
 
 
316 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.96 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  37.99 
 
 
315 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
314 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  36.25 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 
318 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
333 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  36.12 
 
 
330 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  36.12 
 
 
330 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  34.17 
 
 
233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  34.17 
 
 
233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  51.9 
 
 
81 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  51.9 
 
 
81 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2479  glycosyl transferase, group 1  37.25 
 
 
347 aa  59.7  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
392 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
394 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
394 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  35.19 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
394 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
394 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
394 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  39.81 
 
 
346 aa  46.6  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
382 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
356 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.26 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.26 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 
363 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
411 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  31.97 
 
 
416 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  32.26 
 
 
435 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
409 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>