45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2456 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
319 aa  628  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  72.56 
 
 
319 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  64.91 
 
 
350 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  65.33 
 
 
326 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  62.93 
 
 
315 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  60.68 
 
 
325 aa  359  4e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  60.99 
 
 
325 aa  359  4e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  58.28 
 
 
314 aa  348  8e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  58.88 
 
 
342 aa  345  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  59.18 
 
 
338 aa  335  7.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  39.06 
 
 
315 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 
328 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
314 aa  205  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
316 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  37.81 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  37.81 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
333 aa  195  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  34.15 
 
 
347 aa  195  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  37.81 
 
 
316 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  37.81 
 
 
316 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  37.5 
 
 
316 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  37.81 
 
 
330 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  34.49 
 
 
465 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.19 
 
 
316 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  36.88 
 
 
316 aa  188  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.46 
 
 
316 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  36.28 
 
 
318 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  34.07 
 
 
329 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  37.34 
 
 
330 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  37.34 
 
 
330 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  33.62 
 
 
233 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  33.62 
 
 
233 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  47.37 
 
 
81 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  47.37 
 
 
81 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 
382 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  32.71 
 
 
400 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
409 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2479  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 
409 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
411 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 
363 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
382 aa  43.1  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  31.67 
 
 
349 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  26.72 
 
 
394 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  28.04 
 
 
391 aa  42.4  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>