More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3105 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
328 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  60.32 
 
 
314 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  53.33 
 
 
465 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  49.37 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  49.52 
 
 
330 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  47.28 
 
 
333 aa  306  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  47.77 
 
 
316 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  47.12 
 
 
316 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  48.08 
 
 
315 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  46.79 
 
 
316 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  46.79 
 
 
316 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  47.65 
 
 
330 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  47.65 
 
 
330 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  45.09 
 
 
347 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  45.86 
 
 
318 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  45.22 
 
 
316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  45.22 
 
 
316 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.59 
 
 
316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  44.59 
 
 
316 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.59 
 
 
316 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  38.36 
 
 
315 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 
319 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  38.97 
 
 
342 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  46.46 
 
 
233 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  46.46 
 
 
233 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  37.93 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  36.22 
 
 
338 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  35.58 
 
 
326 aa  188  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
350 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  37.23 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  35.17 
 
 
325 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  35.38 
 
 
325 aa  175  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2850  hypothetical protein  39.18 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
370 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  37.25 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
382 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
377 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
403 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
431 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
404 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  39.73 
 
 
81 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
426 aa  55.8  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  39.73 
 
 
81 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
398 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
363 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
371 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
411 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  20.18 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
372 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2121  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
372 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.430294  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2417  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
373 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1118  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.65 
 
 
392 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.357165  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 
389 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  32.65 
 
 
377 aa  53.5  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  24.24 
 
 
350 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  37 
 
 
411 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  32.63 
 
 
393 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
381 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
393 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
382 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 
689 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1760  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
428 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 
382 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
377 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 
382 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1718  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
433 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3087  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
411 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1862  glucosyltransferase  29.49 
 
 
405 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 
419 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
406 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5077  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
410 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
393 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5783  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
410 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
416 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  41.1 
 
 
452 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4395  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
384 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 
376 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
1080 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3344  glycosyl transferase, group 1  22.64 
 
 
445 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
367 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
385 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
372 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
401 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
387 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
391 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
399 aa  50.1  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4457  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
373 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
404 aa  49.7  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  37.84 
 
 
414 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>