94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  100 
 
 
314 aa  627  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  58.28 
 
 
319 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  57.23 
 
 
342 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  60.44 
 
 
326 aa  347  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  57.32 
 
 
315 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  57.59 
 
 
350 aa  332  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  56.83 
 
 
338 aa  328  9e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  55.52 
 
 
325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  55.21 
 
 
325 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  59.37 
 
 
319 aa  316  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
328 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  38.83 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 
315 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  37.82 
 
 
316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  35.26 
 
 
347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
465 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  38.78 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  38.78 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  35.87 
 
 
330 aa  196  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  35.24 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 
318 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  38.41 
 
 
316 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.1 
 
 
316 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.78 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  37.18 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  38.29 
 
 
330 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  38.29 
 
 
330 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  34.93 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  34.93 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
382 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
382 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
382 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  43.04 
 
 
81 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  43.04 
 
 
81 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  34.55 
 
 
382 aa  53.5  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
392 aa  52.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1812  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
407 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0100815  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  36.26 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 
394 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 
394 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 
394 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
393 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
393 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  33.58 
 
 
366 aa  49.7  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
394 aa  49.3  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
374 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4369  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
416 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00420943  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  35 
 
 
392 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
365 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  23.01 
 
 
378 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0204  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
351 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2479  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
347 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  28.57 
 
 
365 aa  46.6  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
388 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
347 aa  46.2  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  30.77 
 
 
416 aa  45.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  28.89 
 
 
391 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  34.18 
 
 
400 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 
374 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 
412 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 
471 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
412 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2850  hypothetical protein  21.43 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
372 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
380 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 
362 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  30.77 
 
 
435 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
424 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
424 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
424 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
394 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  37.27 
 
 
363 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  37.84 
 
 
378 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
368 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
363 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0054  glycosyl transferase group 1  20.39 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510495  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 
398 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
443 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0147  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
351 aa  42.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
384 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
342 aa  42.7  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0044  glycosyltransferase  26.96 
 
 
353 aa  42.7  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 
386 aa  42.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
359 aa  42.4  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>