56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0354 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0354  transferase  100 
 
 
338 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  71.47 
 
 
342 aa  478  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  59.18 
 
 
319 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  56.83 
 
 
314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  57.63 
 
 
350 aa  326  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  58.77 
 
 
326 aa  325  9e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  54.63 
 
 
315 aa  315  8e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  55.28 
 
 
325 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  60.31 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  53.11 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  37.22 
 
 
314 aa  206  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
465 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  37.96 
 
 
316 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  37.96 
 
 
316 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  37.27 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  37.69 
 
 
316 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  37.69 
 
 
316 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 
318 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  37.15 
 
 
316 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  38.36 
 
 
316 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.36 
 
 
316 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  36.02 
 
 
329 aa  184  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.05 
 
 
316 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  36.09 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  33.44 
 
 
347 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  39.24 
 
 
315 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
330 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
330 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  34.89 
 
 
233 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  34.89 
 
 
233 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  22.55 
 
 
365 aa  52.8  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  43.42 
 
 
81 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  43.42 
 
 
81 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  30.48 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0044  glycosyltransferase  24.79 
 
 
353 aa  46.6  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  31.68 
 
 
400 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.65 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
378 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
456 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
393 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
370 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3275  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
352 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  37.18 
 
 
409 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
393 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2824  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
352 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
347 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5208  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
425 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  normal  0.673241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3536  glycosyl transferase, group 1 family protein PslI  31.58 
 
 
366 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.717372  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1122  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
417 aa  42.7  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.775323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>