More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4101 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
393 aa  798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  94.66 
 
 
393 aa  760    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  77.66 
 
 
385 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  70.42 
 
 
382 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  70.42 
 
 
382 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  70.42 
 
 
382 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  36.86 
 
 
374 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  38.5 
 
 
360 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  38.23 
 
 
360 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  37.53 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3265  CpsI  38.2 
 
 
360 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3214  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.1 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 
365 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3252  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.38 
 
 
361 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
390 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05199  glycosyltransferase  27.76 
 
 
343 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  27.27 
 
 
369 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.56 
 
 
356 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
358 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  31.34 
 
 
419 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
400 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
401 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
399 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
382 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001318  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsI glycosyltransferase  28.39 
 
 
343 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
378 aa  96.7  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  31.61 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
379 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
374 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
396 aa  94  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
374 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
385 aa  90.9  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
376 aa  90.1  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
353 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1347  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
353 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.407734  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 
388 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
388 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
371 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
407 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
392 aa  86.3  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1311  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
353 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1328  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
353 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  29.58 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
378 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
403 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  25.58 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  27.04 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
704 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
904 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0953  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517229  normal  0.256855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.64 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  27.62 
 
 
371 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  22.15 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  22.91 
 
 
745 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
304 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  25.08 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
689 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.93 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.08 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  25.08 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  21.81 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  22.48 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  22.67 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  21.59 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  21.59 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  22.25 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.31 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  22.25 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  38.54 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>