53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1572 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 350 aa  690    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  64.91 
 
 		 319 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  65.54 
 
 		 326 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  67.19 
 
 		 319 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  59.88 
 
 		 315 aa  359  4e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  60.19 
 
 		 325 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  60.82 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  55.8 
 
 		 342 aa  335  7.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  57.59 
 
 		 314 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  57.63 
 
 		 338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  41.85 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  34.36 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  39.44 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  39.44 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  37.77 
 
 		 465 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  39.57 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  39.57 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  39.32 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  39.63 
 
 		 315 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  36.53 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.07 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  36.14 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 		 318 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.07 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  37.76 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  38.05 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  38.05 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  34.98 
 
 		 233 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  34.98 
 
 		 233 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2479  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  41.98 
 
 		 81 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  41.98 
 
 		 81 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 		 392 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  33.91 
 
 		 400 aa  53.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 378 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  39.29 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  39.29 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  37.97 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  39.24 
 
 		 460 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  37.97 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 		 409 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>