40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1747 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  647    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  93.85 
 
 
325 aa  586  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  62.42 
 
 
315 aa  378  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  60.99 
 
 
319 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  61.92 
 
 
326 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  60.82 
 
 
350 aa  352  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  57.73 
 
 
342 aa  344  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  62.77 
 
 
319 aa  341  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  55.21 
 
 
314 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  55.28 
 
 
338 aa  316  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  39.56 
 
 
315 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
333 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
328 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 
318 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  38.34 
 
 
330 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  34.56 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.3 
 
 
316 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  37.3 
 
 
316 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
465 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.3 
 
 
316 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  36.45 
 
 
316 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  36.45 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 
316 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 
316 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  40.31 
 
 
330 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  40.31 
 
 
330 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  34.36 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 
316 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  32.63 
 
 
233 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  32.63 
 
 
233 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  47.95 
 
 
81 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  47.95 
 
 
81 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
392 aa  53.1  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4369  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
416 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00420943  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1428  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.04 
 
 
352 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
387 aa  46.2  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2850  hypothetical protein  29.27 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 
388 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>