More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1428 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1428  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
352 aa  699    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
392 aa  86.3  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  29.79 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  29.1 
 
 
400 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0316  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
424 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.451798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.07 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  28.81 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  30.86 
 
 
935 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.88 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
383 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
382 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
396 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.12 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  25.12 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  25.12 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  25.12 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.12 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.94 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.64 
 
 
381 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  28.67 
 
 
490 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  28.67 
 
 
490 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.64 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.76 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
408 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
387 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
421 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 
426 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
392 aa  63.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
395 aa  63.2  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
367 aa  63.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
378 aa  63.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
425 aa  62.8  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
380 aa  62.8  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
392 aa  62.8  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.26 
 
 
366 aa  62.8  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
378 aa  62.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.54 
 
 
371 aa  62.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1608  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
380 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.872915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  40.95 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  29.91 
 
 
385 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
772 aa  61.6  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  25.82 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02930  glycosyltransferase  24.54 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
375 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  29.12 
 
 
372 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
819 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
395 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.76 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
374 aa  60.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 
421 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  30.94 
 
 
822 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
370 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
428 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1097  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
349 aa  60.5  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.372916  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
394 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
401 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
426 aa  60.1  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
381 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  27.39 
 
 
347 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  28.08 
 
 
383 aa  60.1  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
399 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
390 aa  59.7  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
383 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
381 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
415 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0077  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  30.22 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
382 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  28.81 
 
 
408 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26 
 
 
745 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0498  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.86 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0148248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>