More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3293 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
392 aa  815    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  48.44 
 
 
384 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  41.5 
 
 
410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  47.23 
 
 
393 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  45.17 
 
 
390 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  39.59 
 
 
391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  40.41 
 
 
394 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  45.43 
 
 
391 aa  278  9e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  40.65 
 
 
404 aa  266  7e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  39.24 
 
 
401 aa  252  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  35.86 
 
 
392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
415 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
387 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
414 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
409 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
426 aa  176  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  31.52 
 
 
401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 
398 aa  169  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
435 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
403 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  29.95 
 
 
401 aa  162  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
403 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
402 aa  161  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
403 aa  159  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
404 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1095  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174275  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1203  glycosyl transferase, group 1  35.66 
 
 
386 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359152  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
424 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
426 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
384 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
536 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3130  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
448 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
434 aa  106  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
441 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  37.31 
 
 
353 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  31.16 
 
 
403 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
403 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
355 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
434 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
418 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
422 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4167  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
409 aa  99.8  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4199  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3317  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3402  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
448 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  31.05 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
443 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
539 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
424 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 
381 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
380 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  29.72 
 
 
413 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
405 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
377 aa  93.2  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.24 
 
 
380 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.75 
 
 
380 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
414 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2590  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 
410 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
428 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
377 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.93 
 
 
380 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1719  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
421 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  29.34 
 
 
425 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
377 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  26.02 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.24 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
353 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
819 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
425 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.47 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6753  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 
446 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.08 
 
 
935 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3275  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
352 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  26.88 
 
 
778 aa  87  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  25.73 
 
 
382 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
422 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
387 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  36 
 
 
371 aa  87  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
414 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 
427 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
403 aa  86.7  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
410 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
402 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>