More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0408 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
410 aa  804    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  45.25 
 
 
388 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  40.99 
 
 
274 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
418 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  42.42 
 
 
405 aa  146  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  37.01 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  37.05 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
408 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  29.22 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  29.88 
 
 
413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
402 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
402 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  29.57 
 
 
399 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  30.79 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  30.05 
 
 
402 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  37.02 
 
 
432 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
456 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
417 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
417 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
402 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 
1340 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  28.74 
 
 
405 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
415 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
405 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
415 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
703 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
360 aa  106  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  25.93 
 
 
415 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
415 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
404 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  34.82 
 
 
387 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
401 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
1156 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  36.41 
 
 
700 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
422 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
376 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  37.58 
 
 
416 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
396 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
389 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  39.06 
 
 
429 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 
413 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  38.71 
 
 
399 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  34.77 
 
 
371 aa  100  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
994 aa  99.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  28.87 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  33.88 
 
 
408 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
435 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  40.36 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
397 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  37.9 
 
 
422 aa  97.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
443 aa  96.3  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  33.53 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
401 aa  93.6  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  41.91 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
434 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  25.61 
 
 
1119 aa  92  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
417 aa  92  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
429 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.12 
 
 
413 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
407 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 
436 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  34.33 
 
 
442 aa  89.7  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 
399 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  31.91 
 
 
394 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 
406 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 
1106 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 
394 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 
435 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  25.15 
 
 
402 aa  87.8  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  35.12 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  17.58 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  29.68 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
956 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  40.5 
 
 
468 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  37.91 
 
 
691 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  25.44 
 
 
429 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
535 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  29.55 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  28.47 
 
 
407 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 
691 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  32.31 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>