133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2710 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  831    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  82.96 
 
 		 407 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  66.08 
 
 		 429 aa  557  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  57.25 
 
 		 419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  53.03 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  52.27 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  52.01 
 
 		 410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  45.86 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02426  putative glycosyltransferase  45.76 
 
 		 423 aa  353  4e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  40.1 
 
 		 410 aa  343  4e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88208  predicted protein  33.02 
 
 		 476 aa  199  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0321312  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 		 1340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  34.09 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 		 443 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 956 aa  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 		 994 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 535 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  38.78 
 
 		 703 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  32.04 
 
 		 700 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  26.47 
 
 		 1119 aa  106  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 1156 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  23.33 
 
 		 860 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 499 aa  96.7  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 1106 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  30.99 
 
 		 537 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 902 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  30 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 389 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 		 691 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 		 691 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 824 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 422 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 		 691 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 683 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  26.18 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  28.99 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  29.26 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 		 1152 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  31.68 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  26.06 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  31.06 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  31.25 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  22.67 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  26.09 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  26.82 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 892 aa  66.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  29.94 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  37.86 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.47 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  27.01 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.63 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  18.88 
 
 		 392 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  31.97 
 
 		 1837 aa  56.6  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  33.04 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>