296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3535 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  100 
 
 
405 aa  829    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  91.11 
 
 
405 aa  758    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  62.72 
 
 
405 aa  534  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  59.85 
 
 
415 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  59.6 
 
 
415 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  57.92 
 
 
402 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  59.6 
 
 
415 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  57.67 
 
 
402 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  59.6 
 
 
415 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 
421 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
402 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
407 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
402 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
434 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
432 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  28.54 
 
 
436 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
404 aa  126  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
402 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  26.78 
 
 
413 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
409 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
405 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  24.75 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
399 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
399 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
405 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
411 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  23.54 
 
 
396 aa  110  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  24.12 
 
 
399 aa  109  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
360 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
403 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 
404 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
406 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
1340 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  31.67 
 
 
442 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
408 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
396 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.75 
 
 
429 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
409 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
410 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
417 aa  100  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
703 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
413 aa  97.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
499 aa  96.3  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.51 
 
 
413 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
412 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  28.32 
 
 
420 aa  93.2  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
406 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  26.82 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  24.82 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
387 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  37.5 
 
 
443 aa  90.5  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  22 
 
 
394 aa  89.7  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
443 aa  89.4  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
401 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  25.52 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 
456 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.79 
 
 
860 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  32.61 
 
 
700 aa  86.7  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  26.81 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  21.34 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
422 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
956 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  27.2 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 
401 aa  77  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  30.77 
 
 
537 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  25.45 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 
417 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 
417 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
1156 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2185  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
437 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  33.56 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
994 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  24.58 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
1106 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  21.31 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>