164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0733 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  818    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
403 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
400 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0755  hypothetical protein  32.8 
 
 
696 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137164  normal  0.184305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0832  hypothetical protein  32.33 
 
 
673 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0792  hypothetical protein  32.02 
 
 
673 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.0948415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1214  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
632 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440668  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3989  hypothetical protein  29.61 
 
 
391 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24687  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  31.71 
 
 
354 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00985  hypothetical protein  25.06 
 
 
648 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
760 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
387 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
274 aa  93.2  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 
387 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3999  hypothetical protein  22.03 
 
 
666 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.954814  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  27.55 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  34.84 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  27.71 
 
 
402 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  27.13 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  25.12 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  36.91 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
499 aa  77  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  25.59 
 
 
405 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  25.87 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  36.13 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  30.71 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  22.83 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  22.75 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
389 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
1156 aa  70.5  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  22.44 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.12 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  25.18 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  32.53 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
421 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
394 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.69 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1311  hypothetical protein  25.61 
 
 
655 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  20.52 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
456 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
1340 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  25 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
703 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
956 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  30.94 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
902 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  35.97 
 
 
408 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
407 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 
401 aa  63.2  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
376 aa  63.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3802  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
1348 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
435 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  31.25 
 
 
860 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  30.32 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
691 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
691 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 
419 aa  62.4  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  27.41 
 
 
419 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
691 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  28.83 
 
 
414 aa  60.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
422 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 
399 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
824 aa  60.1  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
406 aa  59.7  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>