38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00985 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00985  hypothetical protein  100 
 
 
648 aa  1345    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1214  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
632 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440668  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3989  hypothetical protein  33.91 
 
 
391 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24687  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0755  hypothetical protein  30.58 
 
 
696 aa  158  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137164  normal  0.184305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0832  hypothetical protein  30.93 
 
 
673 aa  150  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0792  hypothetical protein  30.22 
 
 
673 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.0948415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3999  hypothetical protein  29.24 
 
 
666 aa  140  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.954814  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  25.06 
 
 
409 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
400 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  32.23 
 
 
354 aa  99  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
403 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
760 aa  73.9  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
499 aa  66.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1075  hypothetical protein  26.47 
 
 
411 aa  58.9  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610333  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1311  hypothetical protein  27.31 
 
 
655 aa  58.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  23.92 
 
 
442 aa  56.6  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  22.12 
 
 
443 aa  51.6  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0344  hypothetical protein  32.43 
 
 
370 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00179291  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  22.12 
 
 
443 aa  51.2  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0934  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
443 aa  50.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00889269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  23.03 
 
 
1156 aa  49.7  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  22.09 
 
 
274 aa  48.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  22.35 
 
 
1340 aa  47.8  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  22.93 
 
 
402 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  22.52 
 
 
417 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
468 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  22 
 
 
399 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  21.23 
 
 
405 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  22.52 
 
 
417 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  22 
 
 
399 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0590  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
414 aa  47.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  23.22 
 
 
399 aa  47  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  22.56 
 
 
703 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25.21 
 
 
413 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
956 aa  45.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  21.59 
 
 
387 aa  44.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 
409 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>