36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3989 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3989  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  795    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0755  hypothetical protein  34.88 
 
 		 696 aa  163  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137164  normal  0.184305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00985  hypothetical protein  33.91 
 
 		 648 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0792  hypothetical protein  36.23 
 
 		 673 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.0948415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0832  hypothetical protein  36.53 
 
 		 673 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1214  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 632 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  28.61 
 
 		 409 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3999  hypothetical protein  27.17 
 
 		 666 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.954814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 403 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  28.69 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 		 760 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 411 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3802  glycosyl transferase, group 1  23.7 
 
 		 1348 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  27.38 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1311  hypothetical protein  25.13 
 
 		 655 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0590  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3256  hypothetical protein  36.59 
 
 		 1199 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  20.25 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2865  hypothetical protein  36.59 
 
 		 1199 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.739863  decreased coverage  0.00031468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2103  glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 		 405 aa  47  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 		 1340 aa  46.6  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  27.66 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  23.67 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0344  hypothetical protein  33.33 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00179291  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  23.85 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 435 aa  43.5  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  50 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>