83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0832 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0792  hypothetical protein  95.39 
 
 		 673 aa  1234    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.0948415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0755  hypothetical protein  84.27 
 
 		 696 aa  1121    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137164  normal  0.184305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0832  hypothetical protein  100 
 
 		 673 aa  1330    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1214  glycosyl transferase group 1  46.53 
 
 		 632 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3989  hypothetical protein  35.31 
 
 		 391 aa  160  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00985  hypothetical protein  30.19 
 
 		 648 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  30.85 
 
 		 409 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  34.11 
 
 		 354 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 403 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 400 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 		 760 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3999  hypothetical protein  25.86 
 
 		 666 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.954814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  33.45 
 
 		 399 aa  87.4  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1311  hypothetical protein  28.63 
 
 		 655 aa  78.2  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1075  hypothetical protein  30.12 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1326  hypothetical protein  28.8 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0103885  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  23.75 
 
 		 703 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  30.91 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  28.05 
 
 		 397 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 		 456 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3802  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 1348 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 		 1156 aa  57.8  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  52.83 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  46.77 
 
 		 394 aa  55.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0344  hypothetical protein  32.43 
 
 		 370 aa  54.3  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00179291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 902 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 		 405 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 		 433 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 		 419 aa  52.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  24.56 
 
 		 443 aa  51.6  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 388 aa  52  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 410 aa  50.8  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 		 1340 aa  50.8  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 403 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 		 443 aa  50.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  35.03 
 
 		 1837 aa  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2865  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1199 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.739863  decreased coverage  0.00031468 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  39.06 
 
 		 417 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  24.76 
 
 		 419 aa  50.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  24.83 
 
 		 860 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 956 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  36.51 
 
 		 397 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3256  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1199 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 700 aa  49.7  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  23.02 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  24.77 
 
 		 410 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 		 824 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 414 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 		 412 aa  48.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  25.67 
 
 		 399 aa  48.1  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  22.42 
 
 		 994 aa  48.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 		 435 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 409 aa  47.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 		 417 aa  47.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  38.6 
 
 		 402 aa  46.6  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  25.64 
 
 		 405 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  38.98 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 		 408 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 		 360 aa  46.6  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0590  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 414 aa  46.6  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 		 432 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 		 1106 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  39.29 
 
 		 402 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 389 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3237  ATP dependent DNA ligase  57.5 
 
 		 613 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330095  normal  0.222492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  26.82 
 
 		 402 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  27.54 
 
 		 1119 aa  45.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  23.21 
 
 		 537 aa  45.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 405 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  34.48 
 
 		 399 aa  45.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  35.71 
 
 		 413 aa  45.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  43.64 
 
 		 420 aa  45.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  41.07 
 
 		 468 aa  44.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05710  glycosyltransferase  31.29 
 
 		 379 aa  44.3  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 399 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 399 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  35.16 
 
 		 391 aa  44.3  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 		 422 aa  43.9  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 		 376 aa  43.9  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>