82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0792 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0755  hypothetical protein  83.36 
 
 
696 aa  1109    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137164  normal  0.184305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0792  hypothetical protein  100 
 
 
673 aa  1333    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.0948415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0832  hypothetical protein  95.39 
 
 
673 aa  1182    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1214  glycosyl transferase group 1  47.05 
 
 
632 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440668  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3989  hypothetical protein  34.77 
 
 
391 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24687  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00985  hypothetical protein  30.22 
 
 
648 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  30.59 
 
 
409 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
403 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  33.18 
 
 
354 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
400 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 
760 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3999  hypothetical protein  24.85 
 
 
666 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.954814  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1311  hypothetical protein  28.33 
 
 
655 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  32 
 
 
399 aa  82.8  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
499 aa  63.9  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  24.46 
 
 
703 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  25.49 
 
 
1156 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1075  hypothetical protein  31.1 
 
 
411 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610333  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1326  hypothetical protein  28.69 
 
 
364 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0103885  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  29.67 
 
 
442 aa  62  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  27.6 
 
 
397 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  22.5 
 
 
456 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  41.33 
 
 
274 aa  58.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
410 aa  58.2  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  52.83 
 
 
404 aa  57.4  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3802  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
1348 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  46.77 
 
 
394 aa  55.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0344  hypothetical protein  31.43 
 
 
370 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00179291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
902 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 
405 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 
1340 aa  52.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
433 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  25.09 
 
 
443 aa  51.2  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
410 aa  50.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
443 aa  50.4  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
956 aa  50.8  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
388 aa  50.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  36.51 
 
 
397 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 
419 aa  50.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  39.06 
 
 
417 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  34.62 
 
 
1837 aa  50.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
403 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.32 
 
 
700 aa  50.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3256  hypothetical protein  25.44 
 
 
1199 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
994 aa  49.3  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 
824 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2865  hypothetical protein  25.44 
 
 
1199 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.739863  decreased coverage  0.00031468 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.17 
 
 
860 aa  48.9  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  23.11 
 
 
537 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  25.67 
 
 
399 aa  48.1  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  23.81 
 
 
419 aa  48.1  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  25.1 
 
 
405 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  27.27 
 
 
402 aa  47.4  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 
435 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
360 aa  47  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  24.77 
 
 
410 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
412 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
409 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 
417 aa  47.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  39.29 
 
 
402 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  22.26 
 
 
419 aa  46.6  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
376 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  27.38 
 
 
1119 aa  46.6  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  38.6 
 
 
402 aa  46.6  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 
1106 aa  46.6  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 
408 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0590  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
414 aa  46.2  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
432 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  38.98 
 
 
387 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 
389 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  34.48 
 
 
399 aa  45.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05710  glycosyltransferase  31.68 
 
 
379 aa  45.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  43.64 
 
 
420 aa  44.7  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  35.71 
 
 
413 aa  45.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  41.07 
 
 
468 aa  44.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
405 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
1080 aa  44.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
399 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  25.3 
 
 
537 aa  44.3  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
399 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 
422 aa  43.9  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>