45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1311 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1311  hypothetical protein  100 
 
 		 655 aa  1331    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0755  hypothetical protein  26.81 
 
 		 696 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137164  normal  0.184305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0792  hypothetical protein  28.33 
 
 		 673 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.0948415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0832  hypothetical protein  28.63 
 
 		 673 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  31.22 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1214  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 632 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  25.61 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  27.65 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 760 aa  58.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00985  hypothetical protein  27.31 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 400 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  29.05 
 
 		 399 aa  55.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  26.23 
 
 		 402 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 		 371 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  27.69 
 
 		 402 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 403 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  24.36 
 
 		 413 aa  52  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  23.44 
 
 		 1340 aa  51.2  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  25.21 
 
 		 1837 aa  50.8  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 411 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0314  hypothetical protein  30.32 
 
 		 369 aa  48.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 		 360 aa  48.1  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  26.67 
 
 		 513 aa  47.8  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 433 aa  47.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 		 389 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 435 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  30.63 
 
 		 408 aa  47.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3989  hypothetical protein  25.13 
 
 		 391 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 402 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  23.21 
 
 		 443 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  23.5 
 
 		 415 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 		 415 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 406 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 415 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 		 414 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 		 415 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1075  hypothetical protein  26.17 
 
 		 411 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 405 aa  45.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  24.32 
 
 		 405 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 468 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 		 403 aa  44.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  20.93 
 
 		 414 aa  44.3  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>