148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0314 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0314  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  738    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  28.82 
 
 		 413 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 		 422 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 		 405 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 499 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 1106 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  29.48 
 
 		 1119 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 956 aa  79.3  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  38.18 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  27.8 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  32.69 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.07 
 
 		 1340 aa  73.2  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  38.85 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  24.1 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 703 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  30.96 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  33.95 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  30.96 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  36.15 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  33.08 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 		 404 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  29.12 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  33.33 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 402 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  28.96 
 
 		 420 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  32.85 
 
 		 700 aa  66.6  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  25.85 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  23.46 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  28.92 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.05 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 		 691 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  36.19 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 		 691 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  33.63 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 		 994 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  26.94 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 691 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  33.59 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  29.56 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  27.06 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 892 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  34.29 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 418 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  29.05 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  30.53 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1311  hypothetical protein  31.38 
 
 		 655 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  30.9 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  29.12 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>