131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2352 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  851    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
1340 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  26.67 
 
 
442 aa  97.4  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
389 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
402 aa  96.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
387 aa  97.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  28.32 
 
 
405 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  27.98 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 
456 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  28.38 
 
 
402 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
412 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  27.23 
 
 
402 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
405 aa  87  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
703 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  26.6 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
415 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.28 
 
 
700 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
421 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  23.86 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  29.17 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
499 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
1156 aa  72.4  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  26.94 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
956 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
1106 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  29.14 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2185  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  28.8 
 
 
420 aa  67.4  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  24.22 
 
 
413 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 
994 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  22.27 
 
 
860 aa  67  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
422 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  23.6 
 
 
1119 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  24.2 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 
824 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  28.31 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
388 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
902 aa  64.3  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 
407 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
892 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
435 aa  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
408 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  22.75 
 
 
402 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  29.67 
 
 
399 aa  63.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
394 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  25.76 
 
 
394 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
405 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
535 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
360 aa  59.7  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  22.34 
 
 
394 aa  59.7  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1326  hypothetical protein  24.66 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0103885  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
760 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  27.27 
 
 
399 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25.9 
 
 
429 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0314  hypothetical protein  27.78 
 
 
369 aa  57.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 
436 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
435 aa  57  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
409 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  35.16 
 
 
391 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  23.14 
 
 
399 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
417 aa  56.6  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  22.95 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  22.5 
 
 
406 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  27.92 
 
 
537 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
1152 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88208  predicted protein  27.68 
 
 
476 aa  53.9  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0321312  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
387 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 
434 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  32.65 
 
 
409 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
429 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>