16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3999 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3999  hypothetical protein  100 
 
 		 666 aa  1355    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.954814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00985  hypothetical protein  28.85 
 
 		 648 aa  141  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3989  hypothetical protein  27.12 
 
 		 391 aa  115  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0755  hypothetical protein  26.18 
 
 		 696 aa  101  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137164  normal  0.184305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1214  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 632 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0832  hypothetical protein  25.86 
 
 		 673 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0792  hypothetical protein  24.85 
 
 		 673 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.0948415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  21.74 
 
 		 409 aa  83.2  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  25.23 
 
 		 354 aa  55.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 		 397 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 		 535 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  22.09 
 
 		 1156 aa  46.6  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  22.48 
 
 		 1340 aa  46.6  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 443 aa  43.9  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>