83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0934 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0934  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 443 aa  885    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00889269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0590  glycosyl transferase group 1  65.21 
 
 		 414 aa  538  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 760 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  28.91 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0344  hypothetical protein  23.24 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00179291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  30.04 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0105  hypothetical protein  32.8 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0096  hypothetical protein  32.8 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 1340 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4239  hypothetical protein  32.8 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333898  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  27.23 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  25.11 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  26.34 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 405 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00985  hypothetical protein  25.71 
 
 		 648 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 433 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1326  hypothetical protein  20.47 
 
 		 364 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0103885  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 		 404 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 405 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 274 aa  53.1  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  32.37 
 
 		 1837 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1214  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 632 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  37.11 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 		 703 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  20.78 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 399 aa  50.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  32.52 
 
 		 404 aa  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25.96 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  24.46 
 
 		 537 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  24.7 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  25 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0792  hypothetical protein  30.92 
 
 		 673 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.0948415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 387 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 402 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 443 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0832  hypothetical protein  30.43 
 
 		 673 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  29.89 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  25.42 
 
 		 1119 aa  47.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 429 aa  47  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 360 aa  47  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  28.7 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0314  hypothetical protein  38.81 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  22.5 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  26.09 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 535 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  25 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7046  putative glycosyltransferase  29.38 
 
 		 473 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.378884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 391 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0755  hypothetical protein  30.58 
 
 		 696 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137164  normal  0.184305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 432 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  22.53 
 
 		 402 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 892 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 		 376 aa  43.5  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 371 aa  43.1  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2865  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1199 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.739863  decreased coverage  0.00031468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 418 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3256  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1199 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  23.37 
 
 		 1156 aa  43.1  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2103  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 405 aa  43.1  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>