More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5066 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 375 aa  752    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  75.47 
 
 		 416 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  70.83 
 
 		 419 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 		 448 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  40.65 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  32.34 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.11 
 
 		 390 aa  89.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  34.22 
 
 		 343 aa  89.4  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  30 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  41.82 
 
 		 471 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  38.31 
 
 		 377 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2213  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 384 aa  86.7  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.013573  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 		 810 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 371 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 800 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  37.78 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.04 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  39.13 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.6 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  50.59 
 
 		 822 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.21 
 
 		 745 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.71 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.76 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 762 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  34.38 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  30.58 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  28.7 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  35.06 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 660 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  39.89 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  34.66 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.89 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  30.73 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  31.3 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3405  group 1 glycosyl transferase  35.48 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  23.45 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  29.31 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  31.36 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0312  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 		 426 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  39.07 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>