More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3865 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 666 aa  1268    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  55.65 
 
 		 372 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  51.89 
 
 		 359 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  52.79 
 
 		 364 aa  294  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  49.19 
 
 		 357 aa  276  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  50.54 
 
 		 358 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  47.22 
 
 		 397 aa  261  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  48.03 
 
 		 405 aa  244  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 378 aa  186  9e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 		 374 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2351  Methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 270 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 386 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  35.18 
 
 		 381 aa  164  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 395 aa  160  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 396 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 377 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  37.16 
 
 		 375 aa  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 379 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  24.49 
 
 		 384 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  31.34 
 
 		 375 aa  114  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 381 aa  110  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 382 aa  104  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  32.69 
 
 		 374 aa  98.6  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 358 aa  98.6  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 382 aa  96.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  44.76 
 
 		 396 aa  92.8  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  38.62 
 
 		 392 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 374 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 360 aa  76.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  36.43 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 		 414 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  34.16 
 
 		 414 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 		 441 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  35.46 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 400 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 428 aa  67  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 351 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  43.12 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  39.29 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 748 aa  64.7  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.1 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  40.58 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  27.92 
 
 		 425 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  38.27 
 
 		 395 aa  63.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 774 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 		 362 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 		 378 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  41.9 
 
 		 412 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 369 aa  62  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  28.24 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  33.83 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2329  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0153585 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  39.6 
 
 		 403 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  19.71 
 
 		 364 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 367 aa  60.1  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 373 aa  60.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 		 356 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 		 400 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  27.8 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  30.58 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  39.53 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  23.55 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05650  glycosyltransferase  36.63 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.520529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  41.22 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  41.22 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  36.5 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  35.56 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  36.5 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0590  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>