More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1753 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
359 aa  734    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
366 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
374 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
364 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
396 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
397 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
401 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
388 aa  86.3  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  20.74 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  23.94 
 
 
384 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
394 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  21.01 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.1 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 
392 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0955  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.53 
 
 
380 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 
351 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  23.01 
 
 
396 aa  63.9  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
412 aa  63.5  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.28 
 
 
380 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  28.28 
 
 
380 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  21.88 
 
 
361 aa  63.2  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
377 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  27.63 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  22.26 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.28 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
389 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
381 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  22.09 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 
378 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
380 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.77 
 
 
380 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
373 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
360 aa  59.7  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  28.86 
 
 
350 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0055  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.557703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  23.59 
 
 
395 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
422 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
356 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  27.03 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  21.94 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
423 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 
371 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  26.16 
 
 
375 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  22.4 
 
 
770 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.22 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
390 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
819 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.77 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  25 
 
 
342 aa  56.2  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
389 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
379 aa  56.2  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  20.62 
 
 
377 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
666 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  22.49 
 
 
433 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
382 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  23.35 
 
 
393 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  20.86 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  30.45 
 
 
346 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
366 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
410 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 
371 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.75 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0539  glycosyl transferase group 1  20.62 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  23.91 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1141  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
355 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0760697 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
381 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
395 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
375 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
351 aa  53.5  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>