More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56030 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  98.65 
 
 
371 aa  739    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  749    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  72.58 
 
 
373 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  72.02 
 
 
373 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  72.13 
 
 
370 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  72.3 
 
 
373 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  72.58 
 
 
370 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  71.59 
 
 
366 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  64.82 
 
 
372 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3920  glycosyl transferase, group 1  57.97 
 
 
372 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3883  glycosyl transferase group 1  47.11 
 
 
399 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3771  glycosyl transferase group 1  47.11 
 
 
390 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.607496  normal  0.0472047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  42.08 
 
 
410 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
373 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
378 aa  143  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.07 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.33 
 
 
380 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  25.33 
 
 
380 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.6 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.2 
 
 
380 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.07 
 
 
380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1814  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 
391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.67 
 
 
380 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
381 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
427 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  33.77 
 
 
367 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1973  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
370 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  33.04 
 
 
381 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5824  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
411 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  31.58 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 
388 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 
388 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 
388 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
420 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
368 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
376 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  31.79 
 
 
378 aa  113  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
416 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
655 aa  113  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
377 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  28.72 
 
 
382 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  27.51 
 
 
381 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
375 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
378 aa  110  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
810 aa  109  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
393 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
377 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2238  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
398 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38483  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
426 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
377 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
381 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 
434 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  28.19 
 
 
381 aa  106  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 
373 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
378 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  28.89 
 
 
381 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
507 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  27.85 
 
 
382 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  28.04 
 
 
377 aa  104  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
827 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  27.85 
 
 
385 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
377 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  31.82 
 
 
393 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  32.4 
 
 
803 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 
385 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  27.85 
 
 
382 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.7 
 
 
373 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  29.22 
 
 
372 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
381 aa  102  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
378 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  27.82 
 
 
382 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1906  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
394 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  31.15 
 
 
378 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
395 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
387 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
390 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
387 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0755  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
375 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0761  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0775  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193821  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
379 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  27.66 
 
 
456 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  27.66 
 
 
456 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
387 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 
385 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
390 aa  97.4  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  27.27 
 
 
679 aa  97.4  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>