140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0218 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  80.62 
 
 		 482 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 480 aa  956    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0106  glycosyl transferase group 1  57.29 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.341014  normal  0.913948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  50.73 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 1261 aa  156  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 		 1089 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 		 1243 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 		 1028 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 1241 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2300  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.75 
 
 		 598 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3296  WcbH  28.75 
 
 		 598 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0528  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.75 
 
 		 598 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.81282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1071  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.75 
 
 		 598 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108394  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3247  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.75 
 
 		 598 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3282  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.75 
 
 		 598 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.741817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2178  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.75 
 
 		 598 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 1398 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 		 1229 aa  136  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 1915 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3844  hypothetical protein  28.86 
 
 		 427 aa  133  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.429225 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 1241 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  30 
 
 		 787 aa  123  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3987  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 519 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  26.43 
 
 		 743 aa  96.3  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 609 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0290  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0135  hypothetical protein  26.67 
 
 		 368 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 1332 aa  63.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 		 391 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  24.21 
 
 		 404 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  30.94 
 
 		 375 aa  55.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 396 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  25 
 
 		 390 aa  53.9  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 425 aa  53.9  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 386 aa  53.5  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 		 780 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 422 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 		 373 aa  53.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0191  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 		 779 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 		 763 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  22.75 
 
 		 394 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 382 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 393 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 767 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 386 aa  50.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 382 aa  50.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 411 aa  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  23.67 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 397 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 789 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 		 747 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1323  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.17 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.69 
 
 		 382 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 823 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 439 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 425 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 		 761 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  27.89 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 		 419 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 		 372 aa  47.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.56 
 
 		 359 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 		 417 aa  47.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 381 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 358 aa  47.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 		 378 aa  47  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 756 aa  47  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 		 409 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3818  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.406425 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 759 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>