More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2472 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2472  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 419 aa  834    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2841  glycosyl transferase, group 1  80.34 
 
 		 420 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3369  glycosyl transferase group 1  58.27 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0357213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4279  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 		 413 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 		 410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 390 aa  106  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 415 aa  99.8  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 385 aa  96.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 426 aa  96.3  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  35.19 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  23.88 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 396 aa  87  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.71 
 
 		 394 aa  87  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 392 aa  86.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 380 aa  86.7  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 394 aa  87  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 411 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 386 aa  86.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  23.08 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  21.71 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.12 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  30.99 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  23.54 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  30.23 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  28.41 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  34.05 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.1 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.77 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 		 810 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  24.84 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2760  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 1039 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 536 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  27.07 
 
 		 650 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>