40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2645 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2645  mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosaminidase  100 
 
 
512 aa  998    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.708855  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4422  mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosaminidase  69.08 
 
 
310 aa  354  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  0.501395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4993  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  63.64 
 
 
300 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3907  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami nidase  60.44 
 
 
296 aa  321  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21810  chitinase  50.18 
 
 
315 aa  281  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14530  glycosyl hydrolase family 18  52.08 
 
 
309 aa  259  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  48.65 
 
 
1465 aa  153  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  47.31 
 
 
964 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  47.31 
 
 
986 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  47.31 
 
 
986 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  47.31 
 
 
986 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  47.31 
 
 
986 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  47.31 
 
 
986 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  47.31 
 
 
955 aa  144  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  47.31 
 
 
955 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  50 
 
 
1548 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  44.81 
 
 
1084 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  43.01 
 
 
961 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  41.97 
 
 
1176 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.88 
 
 
1212 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  43.96 
 
 
727 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  40.31 
 
 
778 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  39.68 
 
 
794 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.27 
 
 
1357 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  35.14 
 
 
1089 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2597  hypothetical protein  32.42 
 
 
264 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0628  hypothetical protein  37.65 
 
 
694 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  31.72 
 
 
646 aa  64.3  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  28.73 
 
 
864 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  26.97 
 
 
1075 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  36.71 
 
 
360 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  40.79 
 
 
1362 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2508  hypothetical protein  28.68 
 
 
516 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  35.44 
 
 
360 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  35.44 
 
 
360 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  35.44 
 
 
360 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  35.44 
 
 
360 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  35.44 
 
 
360 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  35.44 
 
 
189 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11233  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07160)  32.69 
 
 
677 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.658475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>