19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3907 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3907  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami nidase  100 
 
 		 296 aa  597  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4422  mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosaminidase  68.42 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  0.501395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4993  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  69.06 
 
 		 300 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2645  mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosaminidase  61.28 
 
 		 512 aa  311  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.708855  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14530  glycosyl hydrolase family 18  53.56 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21810  chitinase  55.47 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  29.17 
 
 		 376 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  30.77 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  31.82 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 360 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  31.82 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  31.82 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  31.82 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  31.31 
 
 		 680 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  31.82 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  31.82 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  32.61 
 
 		 827 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11063  class III chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03850)  31.11 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.111184 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  30.34 
 
 		 360 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>