59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1092 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  100 
 
 
613 aa  1267    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  56.08 
 
 
644 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  50 
 
 
978 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  46.72 
 
 
1141 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  44.2 
 
 
841 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  41.98 
 
 
1206 aa  127  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  42.86 
 
 
918 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  42.03 
 
 
14944 aa  115  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  40.44 
 
 
1504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  40.56 
 
 
1172 aa  109  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  39.01 
 
 
1314 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  41.38 
 
 
831 aa  91.3  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  34.44 
 
 
578 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  32.87 
 
 
904 aa  89  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  39.47 
 
 
584 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  31.75 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  34.43 
 
 
654 aa  85.1  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  40 
 
 
2252 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  30.91 
 
 
995 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  33.08 
 
 
4465 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.87 
 
 
1064 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  30.71 
 
 
886 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  30.11 
 
 
778 aa  71.2  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  32.59 
 
 
772 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  27.39 
 
 
2215 aa  69.7  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 
974 aa  64.3  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  31.21 
 
 
966 aa  62.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  26.71 
 
 
884 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  29.31 
 
 
913 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  31.25 
 
 
915 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  29.27 
 
 
913 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  28.37 
 
 
849 aa  60.5  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  28.3 
 
 
2447 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  31.67 
 
 
1293 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0164  protective antigen  30.97 
 
 
764 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0019  PA14 domain protein  30 
 
 
2392 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000236303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  30.53 
 
 
569 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  38.24 
 
 
902 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  23.78 
 
 
897 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  24.39 
 
 
772 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 
913 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  25.47 
 
 
906 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  28.81 
 
 
3802 aa  52.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.53 
 
 
558 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.66 
 
 
765 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  28.42 
 
 
1236 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5704  PA14 domain protein  38.24 
 
 
423 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  26.56 
 
 
914 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  35.29 
 
 
578 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  23.45 
 
 
1276 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  25 
 
 
973 aa  47.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  24.39 
 
 
875 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.96 
 
 
760 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  30.97 
 
 
893 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  28.74 
 
 
889 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  27.44 
 
 
2334 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  26.59 
 
 
864 aa  44.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  21.74 
 
 
891 aa  43.9  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  23.18 
 
 
882 aa  43.9  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>