50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6292 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  60.12 
 
 		 1342 aa  969    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  100 
 
 		 1314 aa  2697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  66.06 
 
 		 1259 aa  1027    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  39.01 
 
 		 644 aa  105  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  39.01 
 
 		 613 aa  101  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  37.14 
 
 		 1141 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  39.72 
 
 		 978 aa  93.2  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  33.72 
 
 		 1206 aa  87.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  35.21 
 
 		 841 aa  86.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  33 
 
 		 14944 aa  85.1  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  38.52 
 
 		 918 aa  73.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  37.89 
 
 		 578 aa  72  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  37.89 
 
 		 584 aa  71.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  37.14 
 
 		 1172 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  25.44 
 
 		 743 aa  67.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  25 
 
 		 778 aa  61.6  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  34.65 
 
 		 904 aa  61.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4260  hypothetical protein  24.33 
 
 		 729 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3571  hypothetical protein  26.8 
 
 		 663 aa  59.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68126  decreased coverage  0.00704751 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  28.11 
 
 		 995 aa  58.9  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  30.7 
 
 		 361 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  29.38 
 
 		 2252 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 		 831 aa  57.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  28.49 
 
 		 2215 aa  56.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  22.04 
 
 		 727 aa  55.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3113  NHL repeat-containing protein  28.51 
 
 		 708 aa  54.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1504 aa  54.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  25.83 
 
 		 2447 aa  52.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  25 
 
 		 886 aa  53.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  42.03 
 
 		 966 aa  52.4  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.29 
 
 		 1064 aa  51.6  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  32.06 
 
 		 654 aa  51.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.14 
 
 		 644 aa  49.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0019  PA14 domain protein  30 
 
 		 2392 aa  48.9  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000236303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2230  hypothetical protein  21.72 
 
 		 733 aa  48.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.42 
 
 		 558 aa  48.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  31.73 
 
 		 889 aa  48.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5074  hypothetical protein  25.14 
 
 		 644 aa  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  23.76 
 
 		 1332 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4392  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.27 
 
 		 644 aa  47.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  28.8 
 
 		 4465 aa  47.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  28.16 
 
 		 772 aa  46.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1023 aa  45.8  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  41.18 
 
 		 5743 aa  45.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  34.29 
 
 		 1585 aa  45.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3085  hypothetical protein  32.31 
 
 		 644 aa  45.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0407  hypothetical protein  32.58 
 
 		 640 aa  45.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  25 
 
 		 569 aa  45.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  30.61 
 
 		 1474 aa  45.1  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6419  hypothetical protein  29.32 
 
 		 644 aa  45.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612972  normal  0.777893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>