68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4260 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  74.27 
 
 
727 aa  1141    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4260  hypothetical protein  100 
 
 
729 aa  1469    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770161  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2230  hypothetical protein  46.09 
 
 
733 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0693  hypothetical protein  46.32 
 
 
727 aa  634  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.315793  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3361  hypothetical protein  45.07 
 
 
738 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3865  hypothetical protein  45.17 
 
 
730 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.647421  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2429  hypothetical protein  44.95 
 
 
775 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0755  hypothetical protein  45.09 
 
 
722 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.974049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1072  hypothetical protein  47.18 
 
 
761 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.437108 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4610  hypothetical protein  44.67 
 
 
738 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0530626  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2290  hypothetical protein  45.61 
 
 
718 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2113  hypothetical protein  44.49 
 
 
738 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3557  hypothetical protein  43.95 
 
 
738 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.744936  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4395  hypothetical protein  44.08 
 
 
738 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3972  hypothetical protein  44.08 
 
 
738 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1968  hypothetical protein  46.29 
 
 
733 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2520  hypothetical protein  44.51 
 
 
808 aa  582  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.432249  normal  0.0659168 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1664  hypothetical protein  43.35 
 
 
722 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0544  hypothetical protein  43.21 
 
 
669 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1872  hypothetical protein  43.21 
 
 
669 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721544  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1707  hypothetical protein  43.35 
 
 
669 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  38.32 
 
 
743 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3113  NHL repeat-containing protein  36.76 
 
 
708 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3571  hypothetical protein  36.14 
 
 
663 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68126  decreased coverage  0.00704751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4607  hypothetical protein  28.89 
 
 
640 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0258623  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5136  hypothetical protein  28.36 
 
 
640 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3464  hypothetical protein  27.81 
 
 
640 aa  201  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6684  hypothetical protein  27.87 
 
 
660 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182376  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0407  hypothetical protein  28.57 
 
 
640 aa  194  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0942  hypothetical protein  27.73 
 
 
638 aa  190  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1927  hypothetical protein  27.73 
 
 
638 aa  190  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4392  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.01 
 
 
644 aa  190  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1229  hypothetical protein  27.91 
 
 
630 aa  189  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2205  hypothetical protein  27.91 
 
 
630 aa  189  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0314  hypothetical protein  27.32 
 
 
638 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390902  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.11 
 
 
644 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0224  hypothetical protein  27.46 
 
 
713 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5074  hypothetical protein  28.11 
 
 
644 aa  187  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1677  hypothetical protein  27.05 
 
 
638 aa  187  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4607  hypothetical protein  27.97 
 
 
638 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0227  hypothetical protein  26.89 
 
 
711 aa  184  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3085  hypothetical protein  27.79 
 
 
644 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6419  hypothetical protein  28.29 
 
 
644 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612972  normal  0.777893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0905  hypothetical protein  28.13 
 
 
638 aa  181  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5062  hypothetical protein  28.23 
 
 
644 aa  180  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.828402  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5247  hypothetical protein  27.38 
 
 
641 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3120  hypothetical protein  27.38 
 
 
641 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5025  hypothetical protein  27.51 
 
 
641 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.932638  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3206  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.5 
 
 
644 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0087  hypothetical protein  27.34 
 
 
647 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1575  hypothetical protein  27.34 
 
 
650 aa  171  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2169  hypothetical protein  27.22 
 
 
638 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1895  hypothetical protein  27.22 
 
 
638 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0906  hypothetical protein  27.22 
 
 
638 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1235  hypothetical protein  27.2 
 
 
641 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1194  hypothetical protein  27.22 
 
 
638 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1516  hypothetical protein  27.2 
 
 
641 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0091  hypothetical protein  27.2 
 
 
641 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0076  hypothetical protein  27.2 
 
 
650 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0837767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0350  hypothetical protein  27.34 
 
 
638 aa  164  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0258  hypothetical protein  27.34 
 
 
638 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1708  hypothetical protein  27.2 
 
 
638 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0111  hypothetical protein  29 
 
 
523 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0077  hypothetical protein  26.37 
 
 
645 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.104126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4648  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.37 
 
 
643 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.652579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  24.33 
 
 
1314 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  26.22 
 
 
1342 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  23.37 
 
 
1259 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>