49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4791 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  100 
 
 		 2252 aa  4653    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0601  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1857 aa  592  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850446  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1521  hypothetical protein  34.28 
 
 		 1807 aa  540  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442861  normal  0.0305188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3209  hypothetical protein  30.45 
 
 		 2395 aa  402  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304767  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  51.55 
 
 		 1206 aa  103  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  51.55 
 
 		 14944 aa  96.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  35.44 
 
 		 644 aa  89.4  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  35.66 
 
 		 978 aa  89  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  36.49 
 
 		 1141 aa  87.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  40.78 
 
 		 918 aa  87.4  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  39.53 
 
 		 1504 aa  83.2  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  40 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  35.82 
 
 		 4465 aa  73.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  32.03 
 
 		 584 aa  69.3  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  31.33 
 
 		 2447 aa  68.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  39.08 
 
 		 904 aa  67  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  32.63 
 
 		 841 aa  66.6  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  39.56 
 
 		 995 aa  66.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2054  fibronectin, type III domain-containing protein  39.36 
 
 		 379 aa  64.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.76 
 
 		 1064 aa  65.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 361 aa  64.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  34.19 
 
 		 578 aa  63.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 831 aa  62.4  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5704  PA14 domain protein  33.68 
 
 		 423 aa  60.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  29.45 
 
 		 1172 aa  59.3  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  35.29 
 
 		 1293 aa  58.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  29.38 
 
 		 1314 aa  57  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  34.58 
 
 		 2334 aa  56.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2055  hypothetical protein  34.65 
 
 		 286 aa  55.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.384632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  37.5 
 
 		 906 aa  53.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  28.1 
 
 		 778 aa  53.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  34.94 
 
 		 886 aa  53.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  34.12 
 
 		 2215 aa  52.8  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2121  YD repeat protein  43.28 
 
 		 1837 aa  52.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873035  normal  0.943874 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0019  PA14 domain protein  31.31 
 
 		 2392 aa  52.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000236303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  33.33 
 
 		 578 aa  52.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  37.66 
 
 		 913 aa  52  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  37.18 
 
 		 772 aa  52  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  36.36 
 
 		 913 aa  51.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1097  YD repeat protein  32.17 
 
 		 1229 aa  50.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.791752  unclonable  0.0000000000274764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  30.3 
 
 		 1236 aa  50.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  29.06 
 
 		 966 aa  50.1  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1049  YD repeat protein  36.56 
 
 		 1084 aa  48.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1960  PA14 domain protein  27.19 
 
 		 204 aa  48.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.372065  hitchhiker  0.00673603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4640  hypothetical protein  38.14 
 
 		 1322 aa  48.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.963654  normal  0.0174413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1394  YD repeat protein  43.94 
 
 		 1129 aa  47.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  33.57 
 
 		 654 aa  48.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  35.42 
 
 		 915 aa  47.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  24.76 
 
 		 569 aa  45.8  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>