17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1049 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1049  YD repeat protein  100 
 
 		 1084 aa  2241    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2667  YD repeat-containing protein  28.61 
 
 		 1152 aa  354  5.9999999999999994e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3730  YD repeat-containing protein  28.61 
 
 		 1152 aa  354  5.9999999999999994e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0100146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1097  YD repeat protein  27.01 
 
 		 1229 aa  264  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.791752  unclonable  0.0000000000274764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3006  YD repeat protein  27.27 
 
 		 1263 aa  147  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4144  YD repeat protein  27.11 
 
 		 1092 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  0.283099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1394  YD repeat protein  28.57 
 
 		 1129 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3186  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1079 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.187937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7100  YD repeat protein  28.14 
 
 		 1065 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4640  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1322 aa  97.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.963654  normal  0.0174413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4387  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1056 aa  95.5  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95296  hitchhiker  0.00457818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2121  YD repeat protein  30.39 
 
 		 1837 aa  94.7  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873035  normal  0.943874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2075  YD repeat protein  24.02 
 
 		 1129 aa  82  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0601  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1857 aa  51.6  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  36.56 
 
 		 2252 aa  48.9  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3209  hypothetical protein  27.68 
 
 		 2395 aa  48.1  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304767  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  33.09 
 
 		 3689 aa  44.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>