21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2121 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2121  YD repeat protein  100 
 
 		 1837 aa  3749    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873035  normal  0.943874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1097  YD repeat protein  28.62 
 
 		 1229 aa  171  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.791752  unclonable  0.0000000000274764 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3730  YD repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1152 aa  141  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0100146  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2667  YD repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1152 aa  141  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3006  YD repeat protein  33.82 
 
 		 1263 aa  119  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1394  YD repeat protein  38.73 
 
 		 1129 aa  103  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5460  hypothetical protein  32.03 
 
 		 338 aa  98.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.024139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1049  YD repeat protein  36.75 
 
 		 1084 aa  94.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7100  YD repeat protein  29.8 
 
 		 1065 aa  85.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4144  YD repeat protein  26.49 
 
 		 1092 aa  82.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  0.283099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3186  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1079 aa  80.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.187937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4640  hypothetical protein  34.58 
 
 		 1322 aa  70.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.963654  normal  0.0174413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4387  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1056 aa  64.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95296  hitchhiker  0.00457818 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3209  hypothetical protein  36.78 
 
 		 2395 aa  60.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304767  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2075  YD repeat protein  29.5 
 
 		 1129 aa  56.2  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0601  hypothetical protein  44.12 
 
 		 1857 aa  55.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850446  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  35 
 
 		 1406 aa  53.5  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  43.28 
 
 		 2252 aa  52  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_003296  RS00945  rhs-related protein  33.63 
 
 		 587 aa  51.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00947  putative RHS-related protein  30.97 
 
 		 499 aa  47.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05538  putative RHS-related protein  29.82 
 
 		 818 aa  45.8  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.252151  normal  0.640714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>