14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3209 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1521  hypothetical protein  32.44 
 
 		 1807 aa  709    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442861  normal  0.0305188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3209  hypothetical protein  100 
 
 		 2395 aa  4919    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304767  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0601  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1857 aa  591  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  30.16 
 
 		 2252 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1522  hypothetical protein  38.62 
 
 		 972 aa  101  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000106004  normal  0.087723 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  38.61 
 
 		 1290 aa  97.8  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4790  hypothetical protein  35.23 
 
 		 553 aa  92.4  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000821118  normal  0.489267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2121  YD repeat protein  36.78 
 
 		 1837 aa  60.1  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873035  normal  0.943874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1097  YD repeat protein  42.65 
 
 		 1229 aa  52  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.791752  unclonable  0.0000000000274764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4640  hypothetical protein  37.35 
 
 		 1322 aa  52  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.963654  normal  0.0174413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1394  YD repeat protein  43.94 
 
 		 1129 aa  51.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  40.43 
 
 		 554 aa  50.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1049  YD repeat protein  27.68 
 
 		 1084 aa  48.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  27.91 
 
 		 2286 aa  47.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>